Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc154Q6RUT8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc154Q6RUT8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc154Q6RUT8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc154Q6RUT8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc154Q6RUT8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc154Q6RUT8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc154Q6RUT8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc154Q6RUT8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc154Q6RUT8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc154Q6RUT8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc154Q6RUT8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc154Q6RUT8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc154Q6RUT8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc154Q6RUT8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc154Q6RUT8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc154Q6RUT8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc154Q6RUT8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc154Q6RUT8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc154Q6RUT8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc154Q6RUT8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc154Q6RUT8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc154Q6RUT8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc154Q6RUT8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc154Q6RUT8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc154Q6RUT8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Ccdc154Q6RUT8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccdc154Q6RUT8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc154Q6RUT8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc154Q6RUT8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc154Q6RUT8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc154Q6RUT8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms