Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt9Q6RHW0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt9Q6RHW0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt9Q6RHW0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt9Q6RHW0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt9Q6RHW0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt9Q6RHW0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt9Q6RHW0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt9Q6RHW0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt9Q6RHW0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt9Q6RHW0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt9Q6RHW0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt9Q6RHW0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt9Q6RHW0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt9Q6RHW0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt9Q6RHW0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt9Q6RHW0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt9Q6RHW0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt9Q6RHW0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt9Q6RHW0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt9Q6RHW0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt9Q6RHW0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt9Q6RHW0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt9Q6RHW0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt9Q6RHW0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt9Q6RHW0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt9Q6RHW0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt9Q6RHW0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt9Q6RHW0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt9Q6RHW0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt9Q6RHW0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt9Q6RHW0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt9Q6RHW0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt9Q6RHW0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt9Q6RHW0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt9Q6RHW0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt9Q6RHW0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt9Q6RHW0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt9Q6RHW0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms