Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1I3

KICSTOR complex protein C12orf66 homolog, mousemouse

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Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P1I3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q6P1I3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q6P1I3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q6P1I3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q6P1I3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q6P1I3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q6P1I3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q6P1I3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6P1I3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6P1I3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6P1I3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6P1I3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6P1I3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6P1I3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6P1I3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6P1I3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6P1I3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6P1I3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6P1I3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6P1I3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6P1I3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6P1I3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6P1I3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6P1I3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6P1I3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6P1I3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6P1I3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6P1I3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6P1I3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6P1I3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6P1I3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6P1I3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6P1I3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6P1I3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6P1I3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6P1I3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6P1I3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q6P1I3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q6P1I3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q6P1I3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q6P1I3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms