Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ0

Ccdc189, Coiled-coil domain-containing protein 189, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc189Q6NZQ0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc189Q6NZQ0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc189Q6NZQ0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc189Q6NZQ0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc189Q6NZQ0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc189Q6NZQ0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc189Q6NZQ0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc189Q6NZQ0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc189Q6NZQ0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc189Q6NZQ0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc189Q6NZQ0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc189Q6NZQ0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc189Q6NZQ0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc189Q6NZQ0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc189Q6NZQ0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc189Q6NZQ0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc189Q6NZQ0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc189Q6NZQ0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc189Q6NZQ0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc189Q6NZQ0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc189Q6NZQ0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc189Q6NZQ0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc189Q6NZQ0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc189Q6NZQ0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc189Q6NZQ0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc189Q6NZQ0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc189Q6NZQ0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc189Q6NZQ0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc189Q6NZQ0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc189Q6NZQ0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc189Q6NZQ0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc189Q6NZQ0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc189Q6NZQ0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc189Q6NZQ0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc189Q6NZQ0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc189Q6NZQ0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms