Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nop58Q6DFW4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nop58Q6DFW4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nop58Q6DFW4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nop58Q6DFW4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nop58Q6DFW4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nop58Q6DFW4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Nop58Q6DFW4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nop58Q6DFW4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nop58Q6DFW4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nop58Q6DFW4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nop58Q6DFW4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nop58Q6DFW4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nop58Q6DFW4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nop58Q6DFW4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nop58Q6DFW4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nop58Q6DFW4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nop58Q6DFW4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nop58Q6DFW4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nop58Q6DFW4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nop58Q6DFW4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nop58Q6DFW4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nop58Q6DFW4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nop58Q6DFW4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nop58Q6DFW4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Nop58Q6DFW4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nop58Q6DFW4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nop58Q6DFW4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nop58Q6DFW4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nop58Q6DFW4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nop58Q6DFW4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nop58Q6DFW4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nop58Q6DFW4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nop58Q6DFW4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nop58Q6DFW4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nop58Q6DFW4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nop58Q6DFW4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Nop58Q6DFW4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Nop58Q6DFW4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nop58Q6DFW4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nop58Q6DFW4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nop58Q6DFW4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nop58Q6DFW4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Nop58Q6DFW4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nop58Q6DFW4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nop58Q6DFW4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nop58Q6DFW4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nop58Q6DFW4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nop58Q6DFW4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nop58Q6DFW4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nop58Q6DFW4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nop58Q6DFW4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nop58Q6DFW4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nop58Q6DFW4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nop58Q6DFW4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nop58Q6DFW4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nop58Q6DFW4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nop58Q6DFW4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nop58Q6DFW4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nop58Q6DFW4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nop58Q6DFW4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nop58Q6DFW4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nop58Q6DFW4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nop58Q6DFW4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nop58Q6DFW4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nop58Q6DFW4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nop58Q6DFW4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nop58Q6DFW4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nop58Q6DFW4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nop58Q6DFW4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nop58Q6DFW4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nop58Q6DFW4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nop58Q6DFW4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nop58Q6DFW4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nop58Q6DFW4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nop58Q6DFW4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nop58Q6DFW4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nop58Q6DFW4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nop58Q6DFW4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nop58Q6DFW4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nop58Q6DFW4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nop58Q6DFW4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nop58Q6DFW4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nop58Q6DFW4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nop58Q6DFW4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nop58Q6DFW4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nop58Q6DFW4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nop58Q6DFW4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Nop58Q6DFW4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nop58Q6DFW4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nop58Q6DFW4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nop58Q6DFW4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nop58Q6DFW4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Nop58Q6DFW4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Nop58Q6DFW4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Nop58Q6DFW4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms