Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cdk13Q69ZA1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cdk13Q69ZA1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cdk13Q69ZA1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cdk13Q69ZA1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Cdk13Q69ZA1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cdk13Q69ZA1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cdk13Q69ZA1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cdk13Q69ZA1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cdk13Q69ZA1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cdk13Q69ZA1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cdk13Q69ZA1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cdk13Q69ZA1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cdk13Q69ZA1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Cdk13Q69ZA1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cdk13Q69ZA1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cdk13Q69ZA1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cdk13Q69ZA1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cdk13Q69ZA1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Cdk13Q69ZA1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cdk13Q69ZA1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cdk13Q69ZA1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cdk13Q69ZA1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cdk13Q69ZA1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cdk13Q69ZA1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cdk13Q69ZA1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cdk13Q69ZA1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Cdk13Q69ZA1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cdk13Q69ZA1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cdk13Q69ZA1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cdk13Q69ZA1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdk13Q69ZA1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdk13Q69ZA1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdk13Q69ZA1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdk13Q69ZA1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cdk13Q69ZA1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cdk13Q69ZA1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cdk13Q69ZA1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdk13Q69ZA1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdk13Q69ZA1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdk13Q69ZA1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdk13Q69ZA1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdk13Q69ZA1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdk13Q69ZA1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdk13Q69ZA1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdk13Q69ZA1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdk13Q69ZA1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdk13Q69ZA1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdk13Q69ZA1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdk13Q69ZA1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdk13Q69ZA1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdk13Q69ZA1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdk13Q69ZA1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdk13Q69ZA1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdk13Q69ZA1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdk13Q69ZA1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdk13Q69ZA1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdk13Q69ZA1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdk13Q69ZA1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdk13Q69ZA1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdk13Q69ZA1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdk13Q69ZA1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdk13Q69ZA1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cdk13Q69ZA1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cdk13Q69ZA1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cdk13Q69ZA1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cdk13Q69ZA1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cdk13Q69ZA1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cdk13Q69ZA1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cdk13Q69ZA1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cdk13Q69ZA1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cdk13Q69ZA1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cdk13Q69ZA1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cdk13Q69ZA1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Cdk13Q69ZA1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cdk13Q69ZA1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cdk13Q69ZA1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cdk13Q69ZA1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cdk13Q69ZA1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdk13Q69ZA1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdk13Q69ZA1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdk13Q69ZA1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdk13Q69ZA1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdk13Q69ZA1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdk13Q69ZA1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdk13Q69ZA1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdk13Q69ZA1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdk13Q69ZA1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdk13Q69ZA1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdk13Q69ZA1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdk13Q69ZA1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdk13Q69ZA1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdk13Q69ZA1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdk13Q69ZA1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdk13Q69ZA1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdk13Q69ZA1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdk13Q69ZA1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdk13Q69ZA1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdk13Q69ZA1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdk13Q69ZA1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms