Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE8

Znf280d, Zinc finger protein 280D, mousemouse

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Length 974 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf280dQ68FE8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf280dQ68FE8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf280dQ68FE8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf280dQ68FE8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf280dQ68FE8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf280dQ68FE8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf280dQ68FE8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf280dQ68FE8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf280dQ68FE8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf280dQ68FE8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf280dQ68FE8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf280dQ68FE8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf280dQ68FE8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf280dQ68FE8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf280dQ68FE8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf280dQ68FE8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znf280dQ68FE8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf280dQ68FE8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf280dQ68FE8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf280dQ68FE8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf280dQ68FE8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf280dQ68FE8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf280dQ68FE8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf280dQ68FE8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf280dQ68FE8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf280dQ68FE8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf280dQ68FE8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znf280dQ68FE8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf280dQ68FE8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf280dQ68FE8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf280dQ68FE8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf280dQ68FE8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf280dQ68FE8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf280dQ68FE8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf280dQ68FE8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf280dQ68FE8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf280dQ68FE8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf280dQ68FE8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf280dQ68FE8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf280dQ68FE8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf280dQ68FE8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znf280dQ68FE8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf280dQ68FE8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf280dQ68FE8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf280dQ68FE8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf280dQ68FE8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf280dQ68FE8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf280dQ68FE8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf280dQ68FE8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znf280dQ68FE8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Znf280dQ68FE8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Znf280dQ68FE8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Znf280dQ68FE8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf280dQ68FE8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf280dQ68FE8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf280dQ68FE8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf280dQ68FE8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf280dQ68FE8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf280dQ68FE8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf280dQ68FE8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf280dQ68FE8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znf280dQ68FE8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf280dQ68FE8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf280dQ68FE8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf280dQ68FE8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf280dQ68FE8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf280dQ68FE8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf280dQ68FE8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf280dQ68FE8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf280dQ68FE8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf280dQ68FE8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf280dQ68FE8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf280dQ68FE8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf280dQ68FE8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf280dQ68FE8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf280dQ68FE8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf280dQ68FE8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf280dQ68FE8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf280dQ68FE8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf280dQ68FE8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf280dQ68FE8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf280dQ68FE8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf280dQ68FE8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf280dQ68FE8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf280dQ68FE8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf280dQ68FE8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf280dQ68FE8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf280dQ68FE8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf280dQ68FE8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf280dQ68FE8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf280dQ68FE8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf280dQ68FE8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf280dQ68FE8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf280dQ68FE8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf280dQ68FE8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf280dQ68FE8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf280dQ68FE8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf280dQ68FE8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf280dQ68FE8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf280dQ68FE8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms