Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Supt6hQ62383 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Supt6hQ62383 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Supt6hQ62383 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Supt6hQ62383 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Supt6hQ62383 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Supt6hQ62383 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Supt6hQ62383 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Supt6hQ62383 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Supt6hQ62383 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Supt6hQ62383 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Supt6hQ62383 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Supt6hQ62383 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Supt6hQ62383 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Supt6hQ62383 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Supt6hQ62383 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Supt6hQ62383 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Supt6hQ62383 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Supt6hQ62383 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Supt6hQ62383 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Supt6hQ62383 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Supt6hQ62383 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Supt6hQ62383 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Supt6hQ62383 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Supt6hQ62383 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Supt6hQ62383 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Supt6hQ62383 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Supt6hQ62383 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Supt6hQ62383 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Supt6hQ62383 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Supt6hQ62383 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Supt6hQ62383 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Supt6hQ62383 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Supt6hQ62383 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Supt6hQ62383 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Supt6hQ62383 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Supt6hQ62383 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Supt6hQ62383 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Supt6hQ62383 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Supt6hQ62383 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Supt6hQ62383 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Supt6hQ62383 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Supt6hQ62383 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Supt6hQ62383 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Supt6hQ62383 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Supt6hQ62383 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Supt6hQ62383 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Supt6hQ62383 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Supt6hQ62383 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Supt6hQ62383 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Supt6hQ62383 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Supt6hQ62383 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Supt6hQ62383 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Supt6hQ62383 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Supt6hQ62383 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Supt6hQ62383 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Supt6hQ62383 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Supt6hQ62383 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Supt6hQ62383 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Supt6hQ62383 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Supt6hQ62383 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Supt6hQ62383 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Supt6hQ62383 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Supt6hQ62383 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Supt6hQ62383 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Supt6hQ62383 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Supt6hQ62383 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Supt6hQ62383 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Supt6hQ62383 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Supt6hQ62383 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Supt6hQ62383 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Supt6hQ62383 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Supt6hQ62383 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Supt6hQ62383 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Supt6hQ62383 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Supt6hQ62383 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Supt6hQ62383 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Supt6hQ62383 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Supt6hQ62383 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Supt6hQ62383 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Supt6hQ62383 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Supt6hQ62383 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Supt6hQ62383 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Supt6hQ62383 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Supt6hQ62383 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Supt6hQ62383 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Supt6hQ62383 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Supt6hQ62383 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Supt6hQ62383 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Supt6hQ62383 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Supt6hQ62383 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Supt6hQ62383 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Supt6hQ62383 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Supt6hQ62383 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Supt6hQ62383 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Supt6hQ62383 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Supt6hQ62383 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Supt6hQ62383 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Supt6hQ62383 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Supt6hQ62383 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms