Protein–RNA interactions for Protein: Q62371

Ddr2, Discoidin domain-containing receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr2Q62371 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddr2Q62371 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddr2Q62371 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddr2Q62371 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddr2Q62371 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddr2Q62371 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ddr2Q62371 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ddr2Q62371 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ddr2Q62371 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ddr2Q62371 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms