Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Taf6Q62311 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Taf6Q62311 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms