Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sall3Q62255 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Sall3Q62255 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Sall3Q62255 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Sall3Q62255 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Sall3Q62255 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Sall3Q62255 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sall3Q62255 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sall3Q62255 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sall3Q62255 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sall3Q62255 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sall3Q62255 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sall3Q62255 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sall3Q62255 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sall3Q62255 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sall3Q62255 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sall3Q62255 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Sall3Q62255 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sall3Q62255 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sall3Q62255 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sall3Q62255 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Sall3Q62255 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Sall3Q62255 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Sall3Q62255 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sall3Q62255 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Sall3Q62255 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Sall3Q62255 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Sall3Q62255 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sall3Q62255 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sall3Q62255 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Sall3Q62255 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sall3Q62255 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sall3Q62255 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Sall3Q62255 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sall3Q62255 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sall3Q62255 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sall3Q62255 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sall3Q62255 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Sall3Q62255 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Sall3Q62255 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Sall3Q62255 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Sall3Q62255 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sall3Q62255 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Sall3Q62255 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Sall3Q62255 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sall3Q62255 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sall3Q62255 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sall3Q62255 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sall3Q62255 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sall3Q62255 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sall3Q62255 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sall3Q62255 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sall3Q62255 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sall3Q62255 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sall3Q62255 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Sall3Q62255 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sall3Q62255 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sall3Q62255 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sall3Q62255 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sall3Q62255 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sall3Q62255 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sall3Q62255 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sall3Q62255 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sall3Q62255 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sall3Q62255 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sall3Q62255 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sall3Q62255 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Sall3Q62255 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sall3Q62255 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sall3Q62255 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sall3Q62255 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sall3Q62255 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sall3Q62255 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sall3Q62255 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sall3Q62255 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Sall3Q62255 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Sall3Q62255 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Sall3Q62255 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Sall3Q62255 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sall3Q62255 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sall3Q62255 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Sall3Q62255 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sall3Q62255 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sall3Q62255 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sall3Q62255 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sall3Q62255 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sall3Q62255 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Sall3Q62255 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Sall3Q62255 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sall3Q62255 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sall3Q62255 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sall3Q62255 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sall3Q62255 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sall3Q62255 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sall3Q62255 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sall3Q62255 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sall3Q62255 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sall3Q62255 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sall3Q62255 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sall3Q62255 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms