Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprrQ62132 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprrQ62132 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprrQ62132 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprrQ62132 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprrQ62132 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprrQ62132 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprrQ62132 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprrQ62132 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprrQ62132 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprrQ62132 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprrQ62132 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprrQ62132 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprrQ62132 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprrQ62132 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprrQ62132 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprrQ62132 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprrQ62132 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprrQ62132 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprrQ62132 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprrQ62132 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprrQ62132 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprrQ62132 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprrQ62132 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprrQ62132 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprrQ62132 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprrQ62132 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprrQ62132 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprrQ62132 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprrQ62132 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprrQ62132 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprrQ62132 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprrQ62132 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprrQ62132 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprrQ62132 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprrQ62132 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprrQ62132 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprrQ62132 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprrQ62132 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprrQ62132 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprrQ62132 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprrQ62132 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprrQ62132 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprrQ62132 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprrQ62132 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PtprrQ62132 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PtprrQ62132 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PtprrQ62132 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprrQ62132 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprrQ62132 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprrQ62132 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprrQ62132 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprrQ62132 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprrQ62132 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprrQ62132 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprrQ62132 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprrQ62132 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprrQ62132 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprrQ62132 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtprrQ62132 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprrQ62132 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprrQ62132 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprrQ62132 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprrQ62132 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprrQ62132 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprrQ62132 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprrQ62132 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprrQ62132 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprrQ62132 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprrQ62132 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprrQ62132 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprrQ62132 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprrQ62132 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprrQ62132 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprrQ62132 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprrQ62132 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprrQ62132 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprrQ62132 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprrQ62132 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprrQ62132 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprrQ62132 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprrQ62132 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprrQ62132 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprrQ62132 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprrQ62132 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprrQ62132 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprrQ62132 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprrQ62132 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprrQ62132 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprrQ62132 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprrQ62132 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprrQ62132 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprrQ62132 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprrQ62132 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprrQ62132 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprrQ62132 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprrQ62132 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprrQ62132 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprrQ62132 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprrQ62132 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms