Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ctr9Q62018 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctr9Q62018 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctr9Q62018 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctr9Q62018 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctr9Q62018 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctr9Q62018 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctr9Q62018 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctr9Q62018 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctr9Q62018 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctr9Q62018 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctr9Q62018 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctr9Q62018 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctr9Q62018 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctr9Q62018 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctr9Q62018 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctr9Q62018 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctr9Q62018 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctr9Q62018 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctr9Q62018 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctr9Q62018 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctr9Q62018 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctr9Q62018 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctr9Q62018 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctr9Q62018 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctr9Q62018 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctr9Q62018 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctr9Q62018 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctr9Q62018 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctr9Q62018 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctr9Q62018 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctr9Q62018 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctr9Q62018 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctr9Q62018 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctr9Q62018 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctr9Q62018 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctr9Q62018 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctr9Q62018 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctr9Q62018 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctr9Q62018 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctr9Q62018 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctr9Q62018 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctr9Q62018 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctr9Q62018 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctr9Q62018 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctr9Q62018 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctr9Q62018 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctr9Q62018 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctr9Q62018 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctr9Q62018 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctr9Q62018 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctr9Q62018 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ctr9Q62018 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ctr9Q62018 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ctr9Q62018 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ctr9Q62018 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ctr9Q62018 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ctr9Q62018 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ctr9Q62018 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ctr9Q62018 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ctr9Q62018 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ctr9Q62018 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctr9Q62018 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctr9Q62018 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctr9Q62018 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctr9Q62018 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctr9Q62018 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctr9Q62018 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctr9Q62018 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctr9Q62018 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctr9Q62018 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctr9Q62018 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms