Protein–RNA interactions for Protein: Q61490

Alcam, CD166 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlcamQ61490 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AlcamQ61490 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AlcamQ61490 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AlcamQ61490 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AlcamQ61490 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AlcamQ61490 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AlcamQ61490 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AlcamQ61490 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AlcamQ61490 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AlcamQ61490 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AlcamQ61490 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AlcamQ61490 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AlcamQ61490 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
AlcamQ61490 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AlcamQ61490 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
AlcamQ61490 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AlcamQ61490 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AlcamQ61490 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AlcamQ61490 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AlcamQ61490 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AlcamQ61490 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AlcamQ61490 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AlcamQ61490 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AlcamQ61490 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AlcamQ61490 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AlcamQ61490 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AlcamQ61490 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AlcamQ61490 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AlcamQ61490 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
AlcamQ61490 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AlcamQ61490 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AlcamQ61490 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AlcamQ61490 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AlcamQ61490 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AlcamQ61490 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AlcamQ61490 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AlcamQ61490 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AlcamQ61490 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AlcamQ61490 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AlcamQ61490 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AlcamQ61490 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AlcamQ61490 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
AlcamQ61490 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AlcamQ61490 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AlcamQ61490 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AlcamQ61490 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AlcamQ61490 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AlcamQ61490 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AlcamQ61490 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AlcamQ61490 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AlcamQ61490 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AlcamQ61490 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AlcamQ61490 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AlcamQ61490 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AlcamQ61490 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AlcamQ61490 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AlcamQ61490 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AlcamQ61490 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AlcamQ61490 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AlcamQ61490 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AlcamQ61490 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AlcamQ61490 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AlcamQ61490 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
AlcamQ61490 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
AlcamQ61490 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AlcamQ61490 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms