Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msi1Q61474 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Msi1Q61474 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Msi1Q61474 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms