Protein–RNA interactions for Protein: Q61286

Tcf12, Transcription factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf12Q61286 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tcf12Q61286 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tcf12Q61286 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tcf12Q61286 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tcf12Q61286 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tcf12Q61286 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tcf12Q61286 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tcf12Q61286 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tcf12Q61286 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tcf12Q61286 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tcf12Q61286 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tcf12Q61286 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tcf12Q61286 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tcf12Q61286 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tcf12Q61286 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tcf12Q61286 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tcf12Q61286 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tcf12Q61286 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tcf12Q61286 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tcf12Q61286 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tcf12Q61286 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Tcf12Q61286 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tcf12Q61286 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tcf12Q61286 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tcf12Q61286 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tcf12Q61286 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tcf12Q61286 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tcf12Q61286 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tcf12Q61286 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tcf12Q61286 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tcf12Q61286 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tcf12Q61286 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tcf12Q61286 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tcf12Q61286 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tcf12Q61286 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tcf12Q61286 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tcf12Q61286 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tcf12Q61286 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tcf12Q61286 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tcf12Q61286 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tcf12Q61286 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tcf12Q61286 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tcf12Q61286 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tcf12Q61286 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tcf12Q61286 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tcf12Q61286 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tcf12Q61286 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tcf12Q61286 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tcf12Q61286 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tcf12Q61286 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tcf12Q61286 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tcf12Q61286 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tcf12Q61286 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tcf12Q61286 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tcf12Q61286 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Tcf12Q61286 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Tcf12Q61286 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tcf12Q61286 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tcf12Q61286 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tcf12Q61286 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tcf12Q61286 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tcf12Q61286 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tcf12Q61286 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tcf12Q61286 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tcf12Q61286 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tcf12Q61286 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tcf12Q61286 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tcf12Q61286 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tcf12Q61286 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tcf12Q61286 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tcf12Q61286 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tcf12Q61286 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tcf12Q61286 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tcf12Q61286 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tcf12Q61286 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tcf12Q61286 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms