Protein–RNA interactions for Protein: Q61165

Slc9a1, Sodium/hydrogen exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a1Q61165 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc9a1Q61165 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc9a1Q61165 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc9a1Q61165 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc9a1Q61165 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc9a1Q61165 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc9a1Q61165 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc9a1Q61165 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc9a1Q61165 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc9a1Q61165 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc9a1Q61165 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc9a1Q61165 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc9a1Q61165 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc9a1Q61165 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc9a1Q61165 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc9a1Q61165 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc9a1Q61165 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc9a1Q61165 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc9a1Q61165 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc9a1Q61165 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc9a1Q61165 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc9a1Q61165 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc9a1Q61165 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc9a1Q61165 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc9a1Q61165 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc9a1Q61165 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc9a1Q61165 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc9a1Q61165 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc9a1Q61165 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc9a1Q61165 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc9a1Q61165 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc9a1Q61165 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc9a1Q61165 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc9a1Q61165 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc9a1Q61165 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc9a1Q61165 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc9a1Q61165 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc9a1Q61165 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc9a1Q61165 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc9a1Q61165 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc9a1Q61165 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc9a1Q61165 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc9a1Q61165 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc9a1Q61165 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc9a1Q61165 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc9a1Q61165 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc9a1Q61165 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc9a1Q61165 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc9a1Q61165 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc9a1Q61165 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc9a1Q61165 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 181.9 ms