Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Traf3Q60803 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Traf3Q60803 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms