Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cdkn2dQ60773 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkn2dQ60773 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms