Protein–RNA interactions for Protein: Q60771

Cldn11, Claudin-11, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn11Q60771 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cldn11Q60771 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn11Q60771 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn11Q60771 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn11Q60771 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn11Q60771 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn11Q60771 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn11Q60771 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn11Q60771 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn11Q60771 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn11Q60771 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn11Q60771 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn11Q60771 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn11Q60771 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn11Q60771 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn11Q60771 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn11Q60771 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn11Q60771 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn11Q60771 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn11Q60771 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn11Q60771 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn11Q60771 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn11Q60771 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn11Q60771 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn11Q60771 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn11Q60771 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn11Q60771 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn11Q60771 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn11Q60771 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn11Q60771 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn11Q60771 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn11Q60771 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn11Q60771 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms