Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SkiQ60698 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SkiQ60698 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SkiQ60698 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SkiQ60698 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SkiQ60698 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SkiQ60698 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.95
SkiQ60698 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SkiQ60698 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SkiQ60698 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SkiQ60698 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SkiQ60698 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SkiQ60698 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SkiQ60698 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SkiQ60698 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SkiQ60698 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SkiQ60698 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SkiQ60698 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SkiQ60698 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SkiQ60698 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SkiQ60698 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SkiQ60698 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SkiQ60698 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SkiQ60698 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SkiQ60698 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SkiQ60698 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SkiQ60698 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SkiQ60698 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SkiQ60698 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SkiQ60698 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SkiQ60698 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SkiQ60698 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SkiQ60698 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SkiQ60698 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SkiQ60698 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SkiQ60698 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SkiQ60698 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SkiQ60698 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SkiQ60698 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SkiQ60698 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SkiQ60698 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms