Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CttnQ60598 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CttnQ60598 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CttnQ60598 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CttnQ60598 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CttnQ60598 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CttnQ60598 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CttnQ60598 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CttnQ60598 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CttnQ60598 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CttnQ60598 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CttnQ60598 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CttnQ60598 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CttnQ60598 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CttnQ60598 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CttnQ60598 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CttnQ60598 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CttnQ60598 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CttnQ60598 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CttnQ60598 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CttnQ60598 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CttnQ60598 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CttnQ60598 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CttnQ60598 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CttnQ60598 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CttnQ60598 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CttnQ60598 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CttnQ60598 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CttnQ60598 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CttnQ60598 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CttnQ60598 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CttnQ60598 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CttnQ60598 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CttnQ60598 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CttnQ60598 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CttnQ60598 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CttnQ60598 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms