Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Myh1Q5SX40 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Myh1Q5SX40 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Myh1Q5SX40 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Myh1Q5SX40 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Myh1Q5SX40 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Myh1Q5SX40 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Myh1Q5SX40 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Myh1Q5SX40 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Myh1Q5SX40 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Myh1Q5SX40 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Myh1Q5SX40 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Myh1Q5SX40 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Myh1Q5SX40 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Myh1Q5SX40 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Myh1Q5SX40 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Myh1Q5SX40 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Myh1Q5SX40 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Myh1Q5SX40 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Myh1Q5SX40 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Myh1Q5SX40 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Myh1Q5SX40 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Myh1Q5SX40 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Myh1Q5SX40 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Myh1Q5SX40 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Myh1Q5SX40 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Myh1Q5SX40 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Myh1Q5SX40 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Myh1Q5SX40 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Myh1Q5SX40 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Myh1Q5SX40 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Myh1Q5SX40 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Myh1Q5SX40 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Myh1Q5SX40 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Myh1Q5SX40 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Myh1Q5SX40 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Myh1Q5SX40 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Myh1Q5SX40 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Myh1Q5SX40 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Myh1Q5SX40 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Myh1Q5SX40 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Myh1Q5SX40 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Myh1Q5SX40 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Myh1Q5SX40 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Myh1Q5SX40 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Myh1Q5SX40 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Myh1Q5SX40 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Myh1Q5SX40 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Myh1Q5SX40 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Myh1Q5SX40 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Myh1Q5SX40 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Myh1Q5SX40 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Myh1Q5SX40 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Myh1Q5SX40 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Myh1Q5SX40 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Myh1Q5SX40 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Myh1Q5SX40 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Myh1Q5SX40 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Myh1Q5SX40 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms