Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Med13Q5SWW4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms