Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tsr1Q5SWD9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tsr1Q5SWD9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tsr1Q5SWD9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tsr1Q5SWD9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tsr1Q5SWD9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tsr1Q5SWD9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tsr1Q5SWD9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tsr1Q5SWD9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tsr1Q5SWD9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tsr1Q5SWD9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tsr1Q5SWD9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tsr1Q5SWD9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tsr1Q5SWD9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tsr1Q5SWD9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tsr1Q5SWD9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tsr1Q5SWD9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tsr1Q5SWD9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tsr1Q5SWD9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tsr1Q5SWD9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tsr1Q5SWD9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tsr1Q5SWD9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tsr1Q5SWD9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tsr1Q5SWD9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tsr1Q5SWD9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tsr1Q5SWD9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tsr1Q5SWD9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tsr1Q5SWD9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tsr1Q5SWD9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tsr1Q5SWD9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tsr1Q5SWD9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tsr1Q5SWD9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tsr1Q5SWD9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tsr1Q5SWD9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tsr1Q5SWD9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tsr1Q5SWD9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tsr1Q5SWD9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tsr1Q5SWD9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tsr1Q5SWD9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tsr1Q5SWD9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tsr1Q5SWD9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tsr1Q5SWD9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tsr1Q5SWD9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tsr1Q5SWD9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tsr1Q5SWD9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tsr1Q5SWD9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tsr1Q5SWD9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tsr1Q5SWD9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tsr1Q5SWD9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tsr1Q5SWD9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tsr1Q5SWD9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tsr1Q5SWD9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tsr1Q5SWD9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tsr1Q5SWD9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Tsr1Q5SWD9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tsr1Q5SWD9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms