Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSF7

Fam46c, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam46cQ5SSF7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fam46cQ5SSF7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fam46cQ5SSF7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Fam46cQ5SSF7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fam46cQ5SSF7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fam46cQ5SSF7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fam46cQ5SSF7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Fam46cQ5SSF7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fam46cQ5SSF7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fam46cQ5SSF7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Fam46cQ5SSF7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Fam46cQ5SSF7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fam46cQ5SSF7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fam46cQ5SSF7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fam46cQ5SSF7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Fam46cQ5SSF7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fam46cQ5SSF7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fam46cQ5SSF7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fam46cQ5SSF7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fam46cQ5SSF7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fam46cQ5SSF7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fam46cQ5SSF7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fam46cQ5SSF7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fam46cQ5SSF7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fam46cQ5SSF7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fam46cQ5SSF7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fam46cQ5SSF7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fam46cQ5SSF7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fam46cQ5SSF7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fam46cQ5SSF7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Fam46cQ5SSF7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fam46cQ5SSF7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fam46cQ5SSF7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fam46cQ5SSF7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fam46cQ5SSF7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fam46cQ5SSF7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fam46cQ5SSF7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fam46cQ5SSF7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fam46cQ5SSF7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fam46cQ5SSF7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fam46cQ5SSF7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fam46cQ5SSF7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fam46cQ5SSF7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fam46cQ5SSF7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fam46cQ5SSF7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Fam46cQ5SSF7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Fam46cQ5SSF7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms