Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQK8

4930512M02Rik, RIKEN cDNA 4930512M02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930512M02RikQ5SQK8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930512M02RikQ5SQK8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930512M02RikQ5SQK8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms