Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPW0

Vps54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps54Q5SPW0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps54Q5SPW0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps54Q5SPW0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps54Q5SPW0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps54Q5SPW0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps54Q5SPW0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps54Q5SPW0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps54Q5SPW0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps54Q5SPW0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps54Q5SPW0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps54Q5SPW0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps54Q5SPW0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps54Q5SPW0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps54Q5SPW0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps54Q5SPW0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps54Q5SPW0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps54Q5SPW0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps54Q5SPW0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps54Q5SPW0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps54Q5SPW0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps54Q5SPW0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps54Q5SPW0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps54Q5SPW0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps54Q5SPW0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps54Q5SPW0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps54Q5SPW0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps54Q5SPW0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps54Q5SPW0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps54Q5SPW0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps54Q5SPW0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps54Q5SPW0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps54Q5SPW0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps54Q5SPW0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps54Q5SPW0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps54Q5SPW0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps54Q5SPW0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps54Q5SPW0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps54Q5SPW0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps54Q5SPW0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps54Q5SPW0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps54Q5SPW0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps54Q5SPW0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps54Q5SPW0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps54Q5SPW0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps54Q5SPW0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps54Q5SPW0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps54Q5SPW0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps54Q5SPW0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps54Q5SPW0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps54Q5SPW0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps54Q5SPW0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps54Q5SPW0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps54Q5SPW0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps54Q5SPW0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps54Q5SPW0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps54Q5SPW0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps54Q5SPW0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vps54Q5SPW0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vps54Q5SPW0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vps54Q5SPW0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps54Q5SPW0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps54Q5SPW0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps54Q5SPW0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps54Q5SPW0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps54Q5SPW0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps54Q5SPW0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps54Q5SPW0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps54Q5SPW0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps54Q5SPW0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps54Q5SPW0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps54Q5SPW0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps54Q5SPW0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps54Q5SPW0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps54Q5SPW0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps54Q5SPW0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps54Q5SPW0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps54Q5SPW0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps54Q5SPW0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps54Q5SPW0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps54Q5SPW0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms