Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Trim41Q5NCC3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Trim41Q5NCC3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Trim41Q5NCC3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Trim41Q5NCC3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Trim41Q5NCC3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Trim41Q5NCC3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Trim41Q5NCC3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Trim41Q5NCC3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Trim41Q5NCC3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Trim41Q5NCC3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Trim41Q5NCC3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Trim41Q5NCC3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Trim41Q5NCC3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Trim41Q5NCC3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Trim41Q5NCC3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Trim41Q5NCC3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Trim41Q5NCC3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Trim41Q5NCC3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Trim41Q5NCC3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Trim41Q5NCC3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Trim41Q5NCC3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Trim41Q5NCC3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Trim41Q5NCC3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Trim41Q5NCC3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
Trim41Q5NCC3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Trim41Q5NCC3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Trim41Q5NCC3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Trim41Q5NCC3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Trim41Q5NCC3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Trim41Q5NCC3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Trim41Q5NCC3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Trim41Q5NCC3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Trim41Q5NCC3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Trim41Q5NCC3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Trim41Q5NCC3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Trim41Q5NCC3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Trim41Q5NCC3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Trim41Q5NCC3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Trim41Q5NCC3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Trim41Q5NCC3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Trim41Q5NCC3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Trim41Q5NCC3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Trim41Q5NCC3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Trim41Q5NCC3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
Trim41Q5NCC3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Trim41Q5NCC3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Trim41Q5NCC3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
Trim41Q5NCC3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Trim41Q5NCC3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Trim41Q5NCC3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Trim41Q5NCC3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Trim41Q5NCC3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Trim41Q5NCC3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Trim41Q5NCC3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Trim41Q5NCC3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Trim41Q5NCC3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Trim41Q5NCC3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Trim41Q5NCC3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Trim41Q5NCC3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Trim41Q5NCC3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Trim41Q5NCC3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Trim41Q5NCC3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Trim41Q5NCC3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Trim41Q5NCC3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Trim41Q5NCC3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Trim41Q5NCC3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Trim41Q5NCC3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Trim41Q5NCC3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Trim41Q5NCC3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Trim41Q5NCC3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Trim41Q5NCC3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Trim41Q5NCC3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Trim41Q5NCC3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Trim41Q5NCC3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Trim41Q5NCC3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Trim41Q5NCC3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Trim41Q5NCC3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Trim41Q5NCC3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Trim41Q5NCC3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Trim41Q5NCC3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Trim41Q5NCC3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Trim41Q5NCC3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Trim41Q5NCC3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Trim41Q5NCC3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Trim41Q5NCC3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Trim41Q5NCC3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Trim41Q5NCC3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Trim41Q5NCC3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Trim41Q5NCC3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Trim41Q5NCC3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Trim41Q5NCC3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Trim41Q5NCC3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Trim41Q5NCC3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Trim41Q5NCC3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Trim41Q5NCC3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Trim41Q5NCC3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Trim41Q5NCC3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Trim41Q5NCC3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Trim41Q5NCC3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms