Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC83

Spata48, Spermatogenesis-associated protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata48Q5NC83 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Spata48Q5NC83 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Spata48Q5NC83 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Spata48Q5NC83 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Spata48Q5NC83 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Spata48Q5NC83 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Spata48Q5NC83 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Spata48Q5NC83 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Spata48Q5NC83 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Spata48Q5NC83 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Spata48Q5NC83 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spata48Q5NC83 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spata48Q5NC83 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spata48Q5NC83 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spata48Q5NC83 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spata48Q5NC83 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spata48Q5NC83 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spata48Q5NC83 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spata48Q5NC83 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spata48Q5NC83 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spata48Q5NC83 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spata48Q5NC83 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spata48Q5NC83 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spata48Q5NC83 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spata48Q5NC83 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spata48Q5NC83 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spata48Q5NC83 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Spata48Q5NC83 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spata48Q5NC83 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spata48Q5NC83 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spata48Q5NC83 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spata48Q5NC83 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spata48Q5NC83 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spata48Q5NC83 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spata48Q5NC83 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spata48Q5NC83 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Spata48Q5NC83 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spata48Q5NC83 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spata48Q5NC83 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spata48Q5NC83 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spata48Q5NC83 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spata48Q5NC83 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spata48Q5NC83 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spata48Q5NC83 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spata48Q5NC83 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spata48Q5NC83 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spata48Q5NC83 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spata48Q5NC83 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spata48Q5NC83 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spata48Q5NC83 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spata48Q5NC83 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spata48Q5NC83 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spata48Q5NC83 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spata48Q5NC83 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spata48Q5NC83 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spata48Q5NC83 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spata48Q5NC83 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spata48Q5NC83 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spata48Q5NC83 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spata48Q5NC83 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Spata48Q5NC83 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Spata48Q5NC83 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Spata48Q5NC83 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spata48Q5NC83 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spata48Q5NC83 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spata48Q5NC83 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spata48Q5NC83 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spata48Q5NC83 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spata48Q5NC83 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spata48Q5NC83 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spata48Q5NC83 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spata48Q5NC83 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spata48Q5NC83 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spata48Q5NC83 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spata48Q5NC83 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spata48Q5NC83 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spata48Q5NC83 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spata48Q5NC83 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spata48Q5NC83 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spata48Q5NC83 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spata48Q5NC83 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spata48Q5NC83 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spata48Q5NC83 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spata48Q5NC83 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spata48Q5NC83 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spata48Q5NC83 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spata48Q5NC83 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spata48Q5NC83 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spata48Q5NC83 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spata48Q5NC83 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spata48Q5NC83 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spata48Q5NC83 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spata48Q5NC83 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spata48Q5NC83 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spata48Q5NC83 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spata48Q5NC83 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spata48Q5NC83 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spata48Q5NC83 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spata48Q5NC83 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spata48Q5NC83 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms