Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBX1

Cobl, Protein cordon-bleu, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CoblQ5NBX1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CoblQ5NBX1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CoblQ5NBX1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CoblQ5NBX1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CoblQ5NBX1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CoblQ5NBX1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CoblQ5NBX1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CoblQ5NBX1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CoblQ5NBX1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CoblQ5NBX1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CoblQ5NBX1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CoblQ5NBX1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CoblQ5NBX1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CoblQ5NBX1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms