Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBX1

Cobl, Protein cordon-bleu, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CoblQ5NBX1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CoblQ5NBX1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CoblQ5NBX1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CoblQ5NBX1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CoblQ5NBX1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CoblQ5NBX1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CoblQ5NBX1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CoblQ5NBX1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CoblQ5NBX1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CoblQ5NBX1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CoblQ5NBX1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CoblQ5NBX1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CoblQ5NBX1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CoblQ5NBX1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CoblQ5NBX1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CoblQ5NBX1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms