Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tnni3kQ5GIG6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnni3kQ5GIG6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnni3kQ5GIG6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnni3kQ5GIG6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnni3kQ5GIG6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnni3kQ5GIG6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnni3kQ5GIG6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnni3kQ5GIG6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnni3kQ5GIG6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tnni3kQ5GIG6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnni3kQ5GIG6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnni3kQ5GIG6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnni3kQ5GIG6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnni3kQ5GIG6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnni3kQ5GIG6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tnni3kQ5GIG6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnni3kQ5GIG6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnni3kQ5GIG6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnni3kQ5GIG6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnni3kQ5GIG6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnni3kQ5GIG6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnni3kQ5GIG6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnni3kQ5GIG6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnni3kQ5GIG6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnni3kQ5GIG6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnni3kQ5GIG6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnni3kQ5GIG6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnni3kQ5GIG6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tnni3kQ5GIG6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnni3kQ5GIG6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnni3kQ5GIG6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnni3kQ5GIG6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnni3kQ5GIG6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnni3kQ5GIG6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnni3kQ5GIG6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnni3kQ5GIG6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tnni3kQ5GIG6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnni3kQ5GIG6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnni3kQ5GIG6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnni3kQ5GIG6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnni3kQ5GIG6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnni3kQ5GIG6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnni3kQ5GIG6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnni3kQ5GIG6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnni3kQ5GIG6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tnni3kQ5GIG6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnni3kQ5GIG6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnni3kQ5GIG6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnni3kQ5GIG6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnni3kQ5GIG6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnni3kQ5GIG6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnni3kQ5GIG6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnni3kQ5GIG6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnni3kQ5GIG6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnni3kQ5GIG6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnni3kQ5GIG6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnni3kQ5GIG6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnni3kQ5GIG6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tnni3kQ5GIG6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnni3kQ5GIG6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnni3kQ5GIG6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnni3kQ5GIG6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnni3kQ5GIG6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnni3kQ5GIG6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnni3kQ5GIG6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tnni3kQ5GIG6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms