Protein–RNA interactions for Protein: Q5C9Z4

NOM1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1Q5C9Z4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NOM1Q5C9Z4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NOM1Q5C9Z4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms