Protein–RNA interactions for Protein: Q52KB6

C2cd3, C2 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2cd3Q52KB6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C2cd3Q52KB6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C2cd3Q52KB6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C2cd3Q52KB6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C2cd3Q52KB6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C2cd3Q52KB6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C2cd3Q52KB6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C2cd3Q52KB6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C2cd3Q52KB6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C2cd3Q52KB6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C2cd3Q52KB6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C2cd3Q52KB6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C2cd3Q52KB6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C2cd3Q52KB6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C2cd3Q52KB6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C2cd3Q52KB6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C2cd3Q52KB6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C2cd3Q52KB6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C2cd3Q52KB6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C2cd3Q52KB6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C2cd3Q52KB6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C2cd3Q52KB6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C2cd3Q52KB6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C2cd3Q52KB6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C2cd3Q52KB6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C2cd3Q52KB6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C2cd3Q52KB6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C2cd3Q52KB6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C2cd3Q52KB6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C2cd3Q52KB6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C2cd3Q52KB6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C2cd3Q52KB6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C2cd3Q52KB6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C2cd3Q52KB6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C2cd3Q52KB6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C2cd3Q52KB6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C2cd3Q52KB6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C2cd3Q52KB6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C2cd3Q52KB6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms