Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhox3aQ4TU90 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhox3aQ4TU90 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhox3aQ4TU90 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhox3aQ4TU90 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhox3aQ4TU90 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhox3aQ4TU90 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhox3aQ4TU90 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhox3aQ4TU90 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhox3aQ4TU90 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhox3aQ4TU90 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhox3aQ4TU90 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhox3aQ4TU90 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhox3aQ4TU90 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhox3aQ4TU90 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhox3aQ4TU90 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhox3aQ4TU90 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhox3aQ4TU90 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhox3aQ4TU90 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhox3aQ4TU90 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhox3aQ4TU90 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhox3aQ4TU90 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhox3aQ4TU90 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rhox3aQ4TU90 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhox3aQ4TU90 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhox3aQ4TU90 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhox3aQ4TU90 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhox3aQ4TU90 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhox3aQ4TU90 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhox3aQ4TU90 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhox3aQ4TU90 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhox3aQ4TU90 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhox3aQ4TU90 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhox3aQ4TU90 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhox3aQ4TU90 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhox3aQ4TU90 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhox3aQ4TU90 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhox3aQ4TU90 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms