Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt35Q497I4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt35Q497I4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt35Q497I4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt35Q497I4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt35Q497I4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt35Q497I4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt35Q497I4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt35Q497I4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt35Q497I4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt35Q497I4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt35Q497I4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt35Q497I4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Krt35Q497I4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Krt35Q497I4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Krt35Q497I4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Krt35Q497I4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Krt35Q497I4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt35Q497I4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt35Q497I4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt35Q497I4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt35Q497I4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt35Q497I4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt35Q497I4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt35Q497I4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt35Q497I4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt35Q497I4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt35Q497I4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt35Q497I4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt35Q497I4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt35Q497I4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt35Q497I4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt35Q497I4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt35Q497I4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt35Q497I4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt35Q497I4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt35Q497I4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt35Q497I4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt35Q497I4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt35Q497I4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt35Q497I4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt35Q497I4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt35Q497I4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt35Q497I4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt35Q497I4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt35Q497I4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt35Q497I4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt35Q497I4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt35Q497I4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt35Q497I4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt35Q497I4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt35Q497I4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt35Q497I4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt35Q497I4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt35Q497I4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt35Q497I4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt35Q497I4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt35Q497I4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt35Q497I4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt35Q497I4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt35Q497I4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt35Q497I4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt35Q497I4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt35Q497I4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt35Q497I4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt35Q497I4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt35Q497I4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt35Q497I4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt35Q497I4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt35Q497I4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt35Q497I4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt35Q497I4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms