Protein–RNA interactions for Protein: Q3V209

Tmub2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub2Q3V209 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmub2Q3V209 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmub2Q3V209 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms