Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrfip1Q3UZ39 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrrfip1Q3UZ39 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrrfip1Q3UZ39 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrfip1Q3UZ39 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrfip1Q3UZ39 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrfip1Q3UZ39 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrfip1Q3UZ39 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrfip1Q3UZ39 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrfip1Q3UZ39 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrfip1Q3UZ39 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrfip1Q3UZ39 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrfip1Q3UZ39 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrfip1Q3UZ39 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrfip1Q3UZ39 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrfip1Q3UZ39 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrfip1Q3UZ39 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrfip1Q3UZ39 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrfip1Q3UZ39 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrfip1Q3UZ39 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrfip1Q3UZ39 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrfip1Q3UZ39 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrfip1Q3UZ39 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrfip1Q3UZ39 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrfip1Q3UZ39 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrfip1Q3UZ39 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrfip1Q3UZ39 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrfip1Q3UZ39 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrfip1Q3UZ39 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrfip1Q3UZ39 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrfip1Q3UZ39 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrfip1Q3UZ39 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrfip1Q3UZ39 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrfip1Q3UZ39 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrfip1Q3UZ39 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrfip1Q3UZ39 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrfip1Q3UZ39 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrfip1Q3UZ39 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrfip1Q3UZ39 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrfip1Q3UZ39 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrfip1Q3UZ39 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrfip1Q3UZ39 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrfip1Q3UZ39 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrfip1Q3UZ39 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrfip1Q3UZ39 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrfip1Q3UZ39 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrfip1Q3UZ39 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrfip1Q3UZ39 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrfip1Q3UZ39 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrfip1Q3UZ39 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrfip1Q3UZ39 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrfip1Q3UZ39 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrfip1Q3UZ39 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrfip1Q3UZ39 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrfip1Q3UZ39 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrfip1Q3UZ39 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrfip1Q3UZ39 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrfip1Q3UZ39 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrfip1Q3UZ39 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrfip1Q3UZ39 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrfip1Q3UZ39 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrfip1Q3UZ39 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrfip1Q3UZ39 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrfip1Q3UZ39 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrfip1Q3UZ39 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrfip1Q3UZ39 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrfip1Q3UZ39 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrfip1Q3UZ39 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrfip1Q3UZ39 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrfip1Q3UZ39 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Lrrfip1Q3UZ39 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrfip1Q3UZ39 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrfip1Q3UZ39 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrfip1Q3UZ39 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrfip1Q3UZ39 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrfip1Q3UZ39 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrfip1Q3UZ39 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrfip1Q3UZ39 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrfip1Q3UZ39 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrfip1Q3UZ39 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrfip1Q3UZ39 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms