Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capn13Q3UW68 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Capn13Q3UW68 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Capn13Q3UW68 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Capn13Q3UW68 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Capn13Q3UW68 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Capn13Q3UW68 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Capn13Q3UW68 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Capn13Q3UW68 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Capn13Q3UW68 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Capn13Q3UW68 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Capn13Q3UW68 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Capn13Q3UW68 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Capn13Q3UW68 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Capn13Q3UW68 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Capn13Q3UW68 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Capn13Q3UW68 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Capn13Q3UW68 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Capn13Q3UW68 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Capn13Q3UW68 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Capn13Q3UW68 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Capn13Q3UW68 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Capn13Q3UW68 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Capn13Q3UW68 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Capn13Q3UW68 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Capn13Q3UW68 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Capn13Q3UW68 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Capn13Q3UW68 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Capn13Q3UW68 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Capn13Q3UW68 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Capn13Q3UW68 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Capn13Q3UW68 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Capn13Q3UW68 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Capn13Q3UW68 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Capn13Q3UW68 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Capn13Q3UW68 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Capn13Q3UW68 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Capn13Q3UW68 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Capn13Q3UW68 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Capn13Q3UW68 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1625.1 ms