Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2-Eb2Q3UUV9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Eb2Q3UUV9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms