Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Skap1Q3UUV5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Skap1Q3UUV5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Skap1Q3UUV5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Skap1Q3UUV5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Skap1Q3UUV5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Skap1Q3UUV5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Skap1Q3UUV5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Skap1Q3UUV5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Skap1Q3UUV5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Skap1Q3UUV5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Skap1Q3UUV5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Skap1Q3UUV5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Skap1Q3UUV5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Skap1Q3UUV5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Skap1Q3UUV5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Skap1Q3UUV5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Skap1Q3UUV5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Skap1Q3UUV5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Skap1Q3UUV5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Skap1Q3UUV5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Skap1Q3UUV5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Skap1Q3UUV5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Skap1Q3UUV5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Skap1Q3UUV5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Skap1Q3UUV5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Skap1Q3UUV5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Skap1Q3UUV5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Skap1Q3UUV5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Skap1Q3UUV5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Skap1Q3UUV5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Skap1Q3UUV5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Skap1Q3UUV5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Skap1Q3UUV5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Skap1Q3UUV5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Skap1Q3UUV5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Skap1Q3UUV5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Skap1Q3UUV5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Skap1Q3UUV5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Skap1Q3UUV5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Skap1Q3UUV5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Skap1Q3UUV5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Skap1Q3UUV5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Skap1Q3UUV5 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Skap1Q3UUV5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Skap1Q3UUV5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Skap1Q3UUV5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Skap1Q3UUV5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Skap1Q3UUV5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Skap1Q3UUV5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Skap1Q3UUV5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Skap1Q3UUV5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Skap1Q3UUV5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Skap1Q3UUV5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Skap1Q3UUV5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Skap1Q3UUV5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Skap1Q3UUV5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Skap1Q3UUV5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Skap1Q3UUV5 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Skap1Q3UUV5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Skap1Q3UUV5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Skap1Q3UUV5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Skap1Q3UUV5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Skap1Q3UUV5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms