Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
D13Ertd608eQ3UPR8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
D13Ertd608eQ3UPR8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
D13Ertd608eQ3UPR8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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