Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrc4Q3UP24 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrc4Q3UP24 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nlrc4Q3UP24 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nlrc4Q3UP24 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nlrc4Q3UP24 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nlrc4Q3UP24 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nlrc4Q3UP24 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nlrc4Q3UP24 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nlrc4Q3UP24 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrc4Q3UP24 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrc4Q3UP24 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrc4Q3UP24 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrc4Q3UP24 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrc4Q3UP24 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrc4Q3UP24 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrc4Q3UP24 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrc4Q3UP24 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrc4Q3UP24 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrc4Q3UP24 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nlrc4Q3UP24 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nlrc4Q3UP24 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nlrc4Q3UP24 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nlrc4Q3UP24 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nlrc4Q3UP24 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nlrc4Q3UP24 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nlrc4Q3UP24 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nlrc4Q3UP24 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nlrc4Q3UP24 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nlrc4Q3UP24 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nlrc4Q3UP24 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nlrc4Q3UP24 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nlrc4Q3UP24 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nlrc4Q3UP24 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nlrc4Q3UP24 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlrc4Q3UP24 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlrc4Q3UP24 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms