Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cobll1Q3UMF0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cobll1Q3UMF0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cobll1Q3UMF0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cobll1Q3UMF0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cobll1Q3UMF0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cobll1Q3UMF0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cobll1Q3UMF0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cobll1Q3UMF0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cobll1Q3UMF0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cobll1Q3UMF0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cobll1Q3UMF0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cobll1Q3UMF0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cobll1Q3UMF0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cobll1Q3UMF0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cobll1Q3UMF0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cobll1Q3UMF0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms