Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CrxosQ3UL53 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CrxosQ3UL53 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms