Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc61Q3UJV1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc61Q3UJV1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc61Q3UJV1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms