Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf224Q3UIW8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf224Q3UIW8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf224Q3UIW8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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