Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Puf60Q3UEB3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Puf60Q3UEB3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Puf60Q3UEB3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Puf60Q3UEB3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Puf60Q3UEB3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Puf60Q3UEB3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Puf60Q3UEB3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Puf60Q3UEB3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Puf60Q3UEB3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Puf60Q3UEB3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Puf60Q3UEB3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Puf60Q3UEB3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Puf60Q3UEB3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Puf60Q3UEB3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Puf60Q3UEB3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Puf60Q3UEB3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Puf60Q3UEB3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Puf60Q3UEB3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Puf60Q3UEB3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Puf60Q3UEB3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Puf60Q3UEB3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Puf60Q3UEB3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Puf60Q3UEB3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Puf60Q3UEB3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Puf60Q3UEB3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Puf60Q3UEB3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Puf60Q3UEB3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Puf60Q3UEB3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Puf60Q3UEB3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Puf60Q3UEB3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Puf60Q3UEB3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Puf60Q3UEB3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Puf60Q3UEB3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Puf60Q3UEB3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Puf60Q3UEB3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Puf60Q3UEB3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Puf60Q3UEB3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Puf60Q3UEB3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Puf60Q3UEB3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Puf60Q3UEB3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Puf60Q3UEB3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Puf60Q3UEB3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Puf60Q3UEB3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Puf60Q3UEB3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Puf60Q3UEB3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Puf60Q3UEB3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Puf60Q3UEB3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Puf60Q3UEB3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Puf60Q3UEB3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Puf60Q3UEB3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Puf60Q3UEB3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Puf60Q3UEB3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Puf60Q3UEB3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Puf60Q3UEB3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Puf60Q3UEB3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Puf60Q3UEB3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Puf60Q3UEB3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Puf60Q3UEB3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Puf60Q3UEB3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Puf60Q3UEB3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Puf60Q3UEB3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Puf60Q3UEB3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Puf60Q3UEB3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Puf60Q3UEB3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Puf60Q3UEB3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Puf60Q3UEB3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Puf60Q3UEB3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Puf60Q3UEB3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Puf60Q3UEB3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Puf60Q3UEB3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Puf60Q3UEB3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Puf60Q3UEB3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Puf60Q3UEB3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Puf60Q3UEB3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Puf60Q3UEB3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Puf60Q3UEB3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Puf60Q3UEB3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Puf60Q3UEB3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Puf60Q3UEB3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Puf60Q3UEB3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Puf60Q3UEB3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Puf60Q3UEB3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Puf60Q3UEB3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Puf60Q3UEB3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Puf60Q3UEB3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Puf60Q3UEB3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Puf60Q3UEB3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Puf60Q3UEB3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Puf60Q3UEB3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Puf60Q3UEB3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Puf60Q3UEB3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Puf60Q3UEB3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Puf60Q3UEB3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Puf60Q3UEB3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Puf60Q3UEB3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Puf60Q3UEB3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Puf60Q3UEB3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Puf60Q3UEB3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Puf60Q3UEB3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
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