Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pid1Q3UBG2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pid1Q3UBG2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pid1Q3UBG2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pid1Q3UBG2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pid1Q3UBG2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pid1Q3UBG2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pid1Q3UBG2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pid1Q3UBG2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pid1Q3UBG2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pid1Q3UBG2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pid1Q3UBG2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pid1Q3UBG2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pid1Q3UBG2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pid1Q3UBG2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pid1Q3UBG2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Pid1Q3UBG2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pid1Q3UBG2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pid1Q3UBG2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pid1Q3UBG2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms