Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc174Q3U155 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms